高危型HPV阳性转为阴性，后期依然有可能变为阳性。高危型HPV持续感染与生殖器癌的发生有密切相关性。
多数女性患者HPV感染处于亚临床感染或潜伏感染，通常8~12个月复查可以转阴，其可能与机体的免疫性有关，但存在着再次感染的可能。并不是感染后体内就会产生抗体而永不复发，性行为频率的增加，也会增加感染HPV的风险。
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生殖器疱疹的外用药物，包括抗病毒类，常见的比如阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏、膦甲酸钠乳膏等。部分生殖器疱疹继发感染时，可选择外用抗生素类药物，常见的比如莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏、复方多粘菌素B软膏等。水泡破溃、糜烂、渗出时，可以选择外用硼酸溶液、生理氯化钠溶液湿敷，还可以选择外用促进创面愈合的药物，比如重组牛碱性成纤维细胞生长因子凝胶等。
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